MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Erwinia sp. Ejp617 plasmid pJE01

Total Repeats: 370

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017442	CAG	2	6	131	136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785383
2	NC_017442	GGC	2	6	227	232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385785383
3	NC_017442	TGT	2	6	244	249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385785383
4	NC_017442	GC	3	6	277	282	0 %	0 %	50 %	50 %	385785383
5	NC_017442	CTG	2	6	343	348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785383
6	NC_017442	AC	3	6	411	416	50 %	0 %	0 %	50 %	385785383
7	NC_017442	T	7	7	449	455	0 %	100 %	0 %	0 %	385785383
8	NC_017442	CTC	2	6	522	527	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385785384
9	NC_017442	AGA	2	6	591	596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385785384
10	NC_017442	TGC	2	6	617	622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785384
11	NC_017442	TGT	2	6	727	732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385785384
12	NC_017442	AGT	2	6	1022	1027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385785385
13	NC_017442	GATTT	2	10	1084	1093	20 %	60 %	20 %	0 %	385785385
14	NC_017442	TGC	2	6	1218	1223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785385
15	NC_017442	CAG	2	6	1227	1232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785385
16	NC_017442	T	7	7	1241	1247	0 %	100 %	0 %	0 %	385785385
17	NC_017442	GTC	2	6	1289	1294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785386
18	NC_017442	ACA	2	6	1295	1300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385785386
19	NC_017442	AAT	2	6	1315	1320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385785386
20	NC_017442	GAT	2	6	1494	1499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385785387
21	NC_017442	GCA	3	9	1504	1512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785387
22	NC_017442	CAG	2	6	1697	1702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785387
23	NC_017442	ATG	2	6	1713	1718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385785387
24	NC_017442	CG	3	6	1794	1799	0 %	0 %	50 %	50 %	385785387
25	NC_017442	AAC	2	6	1806	1811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385785387
26	NC_017442	CA	3	6	1891	1896	50 %	0 %	0 %	50 %	385785387
27	NC_017442	CAC	2	6	1941	1946	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385785388
28	NC_017442	CTGGCT	2	12	1995	2006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785388
29	NC_017442	TGG	2	6	2045	2050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385785388
30	NC_017442	TGC	2	6	2122	2127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785388
31	NC_017442	GTTT	2	8	2224	2231	0 %	75 %	25 %	0 %	385785388
32	NC_017442	GCT	2	6	2252	2257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785388
33	NC_017442	ACA	2	6	2276	2281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385785388
34	NC_017442	TCC	2	6	2290	2295	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385785388
35	NC_017442	CTC	2	6	2307	2312	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385785388
36	NC_017442	CAC	2	6	2343	2348	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385785388
37	NC_017442	CAG	2	6	2403	2408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785388
38	NC_017442	GGT	2	6	2427	2432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385785388
39	NC_017442	GTT	2	6	2481	2486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385785388
40	NC_017442	GCT	2	6	2513	2518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785388
41	NC_017442	CCA	2	6	2570	2575	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385785388
42	NC_017442	AG	3	6	2635	2640	50 %	0 %	50 %	0 %	385785388
43	NC_017442	ACTG	2	8	2655	2662	25 %	25 %	25 %	25 %	385785388
44	NC_017442	CGC	2	6	2732	2737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785388
45	NC_017442	TCA	2	6	3672	3677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385785389
46	NC_017442	ACG	2	6	3716	3721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785389
47	NC_017442	CAG	2	6	3733	3738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785389
48	NC_017442	A	6	6	3758	3763	100 %	0 %	0 %	0 %	385785389
49	NC_017442	GCT	2	6	3908	3913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785390
50	NC_017442	TGG	2	6	3978	3983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385785390
51	NC_017442	GT	3	6	4012	4017	0 %	50 %	50 %	0 %	385785390
52	NC_017442	CTG	2	6	4087	4092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785390
53	NC_017442	CCAC	2	8	4106	4113	25 %	0 %	0 %	75 %	385785390
54	NC_017442	CA	3	6	4152	4157	50 %	0 %	0 %	50 %	385785390
55	NC_017442	ACA	2	6	4188	4193	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385785390
56	NC_017442	GAA	2	6	4198	4203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385785390
57	NC_017442	TTC	2	6	4514	4519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385785391
58	NC_017442	AGGTAA	2	12	4544	4555	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385785391
59	NC_017442	A	7	7	4582	4588	100 %	0 %	0 %	0 %	385785391
60	NC_017442	GAA	2	6	4632	4637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385785391
61	NC_017442	AATT	2	8	4687	4694	50 %	50 %	0 %	0 %	385785392
62	NC_017442	GAT	2	6	4903	4908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385785392
63	NC_017442	CATC	2	8	5301	5308	25 %	25 %	0 %	50 %	385785393
64	NC_017442	ATG	2	6	5391	5396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385785393
65	NC_017442	CAT	2	6	5427	5432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385785393
66	NC_017442	AAG	2	6	5439	5444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385785393
67	NC_017442	CGTA	2	8	5452	5459	25 %	25 %	25 %	25 %	385785393
68	NC_017442	GATTAT	2	12	5471	5482	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385785393
69	NC_017442	TGC	2	6	5584	5589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785393
70	NC_017442	TCGA	2	8	5705	5712	25 %	25 %	25 %	25 %	385785393
71	NC_017442	CAGCG	2	10	5745	5754	20 %	0 %	40 %	40 %	385785393
72	NC_017442	TA	3	6	5762	5767	50 %	50 %	0 %	0 %	385785393
73	NC_017442	AATGAA	2	12	5865	5876	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385785393
74	NC_017442	GCA	2	6	5936	5941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785394
75	NC_017442	A	7	7	5943	5949	100 %	0 %	0 %	0 %	385785394
76	NC_017442	CGA	2	6	5964	5969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785394
77	NC_017442	T	6	6	6000	6005	0 %	100 %	0 %	0 %	385785394
78	NC_017442	TAT	2	6	6767	6772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385785395
79	NC_017442	GGA	2	6	6811	6816	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385785395
80	NC_017442	AGTC	2	8	6873	6880	25 %	25 %	25 %	25 %	385785395
81	NC_017442	AAT	2	6	6921	6926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385785395
82	NC_017442	AGT	2	6	7343	7348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385785396
83	NC_017442	CCT	2	6	7361	7366	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385785396
84	NC_017442	CAG	2	6	7433	7438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785396
85	NC_017442	A	6	6	7554	7559	100 %	0 %	0 %	0 %	385785396
86	NC_017442	CAG	2	6	7643	7648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785396
87	NC_017442	TGA	2	6	7649	7654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385785396
88	NC_017442	CG	3	6	7940	7945	0 %	0 %	50 %	50 %	385785396
89	NC_017442	A	6	6	7989	7994	100 %	0 %	0 %	0 %	385785396
90	NC_017442	TGTCG	2	10	8003	8012	0 %	40 %	40 %	20 %	385785396
91	NC_017442	A	6	6	8292	8297	100 %	0 %	0 %	0 %	385785396
92	NC_017442	ATA	2	6	9307	9312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385785397
93	NC_017442	GCC	2	6	9329	9334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785397
94	NC_017442	T	7	7	9357	9363	0 %	100 %	0 %	0 %	385785397
95	NC_017442	GTC	2	6	9405	9410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785397
96	NC_017442	GTG	2	6	9478	9483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385785397
97	NC_017442	GAA	2	6	9516	9521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385785397
98	NC_017442	GT	3	6	9540	9545	0 %	50 %	50 %	0 %	385785397
99	NC_017442	GCC	2	6	9616	9621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785397
100	NC_017442	TCT	2	6	9622	9627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385785397
101	NC_017442	CCG	2	6	9655	9660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785397
102	NC_017442	CAT	2	6	9708	9713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385785397
103	NC_017442	AAT	2	6	9717	9722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385785397
104	NC_017442	GTCC	2	8	9782	9789	0 %	25 %	25 %	50 %	385785397
105	NC_017442	GCCA	2	8	9874	9881	25 %	0 %	25 %	50 %	385785397
106	NC_017442	CGA	2	6	10118	10123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785397
107	NC_017442	TCACGG	2	12	10228	10239	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	385785397
108	NC_017442	CAG	2	6	10272	10277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785397
109	NC_017442	GGT	2	6	10343	10348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385785397
110	NC_017442	TCAGC	2	10	10352	10361	20 %	20 %	20 %	40 %	385785397
111	NC_017442	T	6	6	11581	11586	0 %	100 %	0 %	0 %	385785398
112	NC_017442	TCA	2	6	11660	11665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385785398
113	NC_017442	CTG	2	6	11727	11732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785398
114	NC_017442	TCT	2	6	11795	11800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385785398
115	NC_017442	ACT	2	6	11852	11857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385785398
116	NC_017442	TTG	2	6	12783	12788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385785399
117	NC_017442	CAC	2	6	12826	12831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385785399
118	NC_017442	GCC	2	6	12854	12859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785399
119	NC_017442	CTT	2	6	12865	12870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385785399
120	NC_017442	ATA	2	6	12920	12925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385785399
121	NC_017442	TAA	2	6	12948	12953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385785399
122	NC_017442	TACC	2	8	13150	13157	25 %	25 %	0 %	50 %	385785399
123	NC_017442	TTG	2	6	13167	13172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385785399
124	NC_017442	AGGA	2	8	13428	13435	50 %	0 %	50 %	0 %	385785399
125	NC_017442	TCCAG	2	10	13486	13495	20 %	20 %	20 %	40 %	385785399
126	NC_017442	TGCG	2	8	13507	13514	0 %	25 %	50 %	25 %	385785399
127	NC_017442	TACC	2	8	13558	13565	25 %	25 %	0 %	50 %	385785399
128	NC_017442	TCA	2	6	13648	13653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385785399
129	NC_017442	T	7	7	13672	13678	0 %	100 %	0 %	0 %	385785399
130	NC_017442	TCAG	2	8	13896	13903	25 %	25 %	25 %	25 %	385785400
131	NC_017442	CCAG	2	8	13954	13961	25 %	0 %	25 %	50 %	385785400
132	NC_017442	CCCG	2	8	14011	14018	0 %	0 %	25 %	75 %	385785400
133	NC_017442	GC	3	6	14135	14140	0 %	0 %	50 %	50 %	385785400
134	NC_017442	CGG	2	6	14228	14233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385785400
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261	NC_017442	CAG	2	6	22144	22149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785409
262	NC_017442	AGC	2	6	22166	22171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785409
263	NC_017442	CCA	2	6	22248	22253	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385785409
264	NC_017442	TAA	2	6	22467	22472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385785409
265	NC_017442	CTGC	2	8	22494	22501	0 %	25 %	25 %	50 %	385785409
266	NC_017442	CGG	2	6	22527	22532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385785409
267	NC_017442	CAT	2	6	22573	22578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385785409
268	NC_017442	ATCG	2	8	22744	22751	25 %	25 %	25 %	25 %	385785410
269	NC_017442	GTTGA	2	10	22759	22768	20 %	40 %	40 %	0 %	385785410
270	NC_017442	TCC	2	6	22786	22791	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385785411
271	NC_017442	GTT	2	6	22796	22801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385785411
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273	NC_017442	CAGGC	2	10	22904	22913	20 %	0 %	40 %	40 %	385785411
274	NC_017442	CGC	2	6	22977	22982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785411
275	NC_017442	CAG	2	6	22986	22991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785411
276	NC_017442	CAT	2	6	22995	23000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385785411
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279	NC_017442	CAT	2	6	23135	23140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385785411
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281	NC_017442	CGC	2	6	23162	23167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785411
282	NC_017442	TCA	2	6	23191	23196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385785411
283	NC_017442	GCT	2	6	23285	23290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785411
284	NC_017442	GGCGC	2	10	23295	23304	0 %	0 %	60 %	40 %	385785411
285	NC_017442	CG	3	6	23438	23443	0 %	0 %	50 %	50 %	385785411
286	NC_017442	CCA	3	9	23450	23458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385785411
287	NC_017442	ACC	2	6	23495	23500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385785411
288	NC_017442	GC	3	6	23540	23545	0 %	0 %	50 %	50 %	385785411
289	NC_017442	GCC	2	6	23574	23579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785411
290	NC_017442	CCCG	2	8	23636	23643	0 %	0 %	25 %	75 %	385785411
291	NC_017442	GCG	2	6	24497	24502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385785412
292	NC_017442	CGGTT	2	10	24547	24556	0 %	40 %	40 %	20 %	385785412
293	NC_017442	TGAT	2	8	24588	24595	25 %	50 %	25 %	0 %	385785412
294	NC_017442	CTG	2	6	24680	24685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785412
295	NC_017442	CCG	2	6	24774	24779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785412
296	NC_017442	CTG	2	6	24800	24805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785412
297	NC_017442	CA	3	6	24814	24819	50 %	0 %	0 %	50 %	385785412
298	NC_017442	GGC	2	6	24861	24866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385785412
299	NC_017442	ATG	2	6	24879	24884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385785412
300	NC_017442	CAACA	2	10	24952	24961	60 %	0 %	0 %	40 %	385785412
301	NC_017442	AGCA	2	8	25356	25363	50 %	0 %	25 %	25 %	385785413
302	NC_017442	CAA	2	6	25416	25421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385785413
303	NC_017442	ATA	2	6	25445	25450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385785413
304	NC_017442	CTT	2	6	25453	25458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385785413
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313	NC_017442	TAA	2	6	25878	25883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385785413
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319	NC_017442	CAG	2	6	26535	26540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785414
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321	NC_017442	GGTA	2	8	26585	26592	25 %	25 %	50 %	0 %	385785414
322	NC_017442	GCAG	2	8	26698	26705	25 %	0 %	50 %	25 %	385785414
323	NC_017442	CTT	2	6	26753	26758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385785414
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327	NC_017442	GCT	2	6	26837	26842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785414
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335	NC_017442	GAT	2	6	27282	27287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385785414
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370	NC_017442	CGC	2	6	30803	30808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785416

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.